独立行政法人(文部科学省所管)の年収(2009年)
総務省の独立行政法人の役職員の給与等の水準（平成21年度）によると2009年度の文部科学省所管独立行政法人の給与は次のようになっています．
| 事務・技術職員 | 平均年間給与 | 平均年齢 | 対象人数 |
| 国立特別支援教育総合研究所 | 586.8万円 | 40.8歳 | 22人 |
| 大学入試センター | 631.1万円 | 41.2歳 | 59人 |
| 国立青少年教育振興機構 | 617.8万円 | 42.2歳 | 345人 |
| 国立女性教育会館 | 566.7万円 | 43.6歳 | 14人 |
| 国立科学博物館 | 643.8万円 | 40.3歳 | 42人 |
| 物質･材料研究機構 | 610.5万円 | 39.8歳 | 81人 |
| 防災科学技術研究所 | 697.4万円 | 43.4歳 | 26人 |
| 放射線医学総合研究所 | 541.9万円 | 41.9歳 | 119人 |
| 国立美術館 | 617.1万円 | 39.0歳 | 43人 |
| 国立文化財機構 | 617.7万円 | 41.5歳 | 92人 |
| 教員研修センター | 682.0万円 | 44.9歳 | 28人 |
| 科学技術振興機構 | 725.9万円 | 40.9歳 | 480人 |
| 日本学術振興会 | 658.1万円 | 37.4歳 | 67人 |
| 理化学研究所 | 748.7万円 | 42.8歳 | 288人 |
| 宇宙航空研究開発機構 | 812.5万円 | 44.2歳 | 413人 |
| 日本スポーツ振興センター | 733.2万円 | 43.6歳 | 278人 |
| 日本芸術文化振興会 | 720.4万円 | 45.9歳 | 208人 |
| 日本学生支援機構 | 741.8万円 | 44.1歳 | 298人 |
| 海洋研究開発機構 | 728.9万円 | 41.7歳 | 141人 |
| 国立高等専門学校機構 | 539.4万円 | 42.6歳 | 1,810人 |
| 大学評価・学位授与機構 | 498.8万円 | 34.4歳 | 87人 |
| 国立大学財務・経営センター | 650.9万円 | 39.2歳 | 15人 |
| 日本原子力研究開発機構 | 795.8万円 | 44.6歳 | 2,663人 |
| 研究職員 | 平均年間給与 | 平均年齢 | 対象人数 |
| 国立特別支援教育総合研究所 | 887.6万円 | 49.0歳 | 39人 |
| 国立女性教育会館 | −万円 | −歳 | 2人 |
| 国立科学博物館 | 943.5万円 | 50.2歳 | 67人 |
| 物質･材料研究機構 | 912.7万円 | 45.9歳 | 387人 |
| 防災科学技術研究所 | 898.5万円 | 45.7歳 | 56人 |
| 放射線医学総合研究所 | 825.3万円 | 45.2歳 | 162人 |
| 国立美術館 | 818.5万円 | 43.9歳 | 55人 |
| 国立文化財機構 | 857.5万円 | 44.5歳 | 161人 |
| 理化学研究所 | 994.6万円 | 45.5歳 | 317人 |
| 宇宙航空研究開発機構 | 839.4万円 | 42.7歳 | 850人 |
| 日本スポーツ振興センター | 887.6万円 | 45.3歳 | 11人 |
| 海洋研究開発機構 | 818.6万円 | 43.5歳 | 58人 |
| 日本原子力研究開発機構 | 869.7万円 | 43.6歳 | 923人 |
| 病院医師 | 平均年間給与 | 平均年齢 | 対象人数 |
| 放射線医学総合研究所 | 1,274.7万円 | 51.1歳 | 13人 |
| 病院看護師 | 平均年間給与 | 平均年齢 | 対象人数 |
| 放射線医学総合研究所 | 559.6万円 | 45.9歳 | 32人 |
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